Will ed Elizabeth, alleatisi con il Capitano Barbossa (riportato in vita dalla strega,amica di Jack, Tia Dalma), si tuffano ai Confini del mondo grazie una nave e una ciurma fornita loro, non senza difficoltà, dal pirata cinese Sao Feng. Il viaggio volge alla disperata ricerca di Jack, finito nello scrigno Davy Jones, una sorta di Limbo post mortem. Intanto, la terrificante 'Olandese Volante', ormai sotto il controllo della Compagnia delle Indie Orientali, che tiene sotto tiro il cuore di Jones, continua ad imperversare per i sette mari.
Una volta liberato Jack e radunata tutta la flotta pirata, Barbossa tenta di convincere il Consiglio dei nove pirati della Fratellanza a liberare la Dea del mare Calypso, imprigionata in un corpo umano, per avere vittoria facile. Ma ogni protagonista ha in riserbo un obiettivo personale nascosto e solo una lunga e intricata serie di tradimenti si frappone tra loro e la battaglia finale contro Jones ed i militari inglesi.